La digestion aérobie est généralement utilisée dans une station de traitement des boues activées. Les boues activées résiduelles et les boues primaires sont combinées, le cas échéant, et passent dans un épaississeur où la teneur en matières solides est augmentée.

Cela réduit considérablement le volume à traiter dans le digesteur. Le procédé est généralement mis en œuvre par lots, avec plus d’une cuve de digestion en fonctionnement à tout moment. Des ventilateurs sont utilisés pour fournir de l’air à travers le réservoir et le contenu est remué pour le maintenir complètement mélangé. Du dioxyde de carbone, de l’air vicié et de petites quantités d’autres gaz, dont le sulfure d’hydrogène, sont dégagés.